Les membres de la SARL Pépin-Hugonnot disposent de compétences leur permettant de mener à bien des projets de recherche appliquée.
À la différence des études et expertises, ce type de projets ne bénéficie d’aucun financement et constitue l’originalité de la structure. Les résultats obtenus dans le cadre de ces activités de recherche, souvent en collaboration avec des organismes externes et des Universités, permettent de contribuer à une meilleure prise en compte des espèces (bryophytes notamment) et des végétations dans le cadre de projets d’aménagement.